Protein–RNA interactions for Protein: P40347

LTP1, Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase, yeastyeast

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LTP1P40347 COX5AYNL052W 462 nt5.54□□□□□ -1.52
LTP1P40347 GIP1YBR045C 1920 nt5.54□□□□□ -1.52
LTP1P40347 LPL1YOR059C 1353 nt5.54□□□□□ -1.52
LTP1P40347 VRP1YLR337C 2454 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 DBP9YLR276C 1785 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 MRE11YMR224C 2079 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 SPT3YDR392W 1014 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 RPL12AYEL054C 498 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 YGR066CYGR066C 879 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 RHO3YIL118W 696 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 PRM10YJL108C 1152 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 GEP5YLR091W 882 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 PHA2YNL316C 1005 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 YCL041CYCL041C 495 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 PGM1YKL127W 1713 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 LAP2YNL045W 2016 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 IML2YJL082W 2196 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 YOL036WYOL036W 2286 nt5.53□□□□□ -1.52
LTP1P40347 CLB5YPR120C 1308 nt5.52□□□□□ -1.53
LTP1P40347 YPR1YDR368W 939 nt5.52□□□□□ -1.53
LTP1P40347 RRP4YHR069C 1080 nt5.52□□□□□ -1.53
LTP1P40347 YKR075CYKR075C 924 nt5.52□□□□□ -1.53
LTP1P40347 SSO1YPL232W 873 nt5.52□□□□□ -1.53
LTP1P40347 YBR124WYBR124W 360 nt5.52□□□□□ -1.53
LTP1P40347 SKY1YMR216C 2229 nt5.52□□□□□ -1.53
LTP1P40347 SFB3YHR098C 2790 nt5.52□□□□□ -1.53
LTP1P40347 STE13YOR219C 2796 nt5.52□□□□□ -1.53
LTP1P40347 SDA1YGR245C 2304 nt5.52□□□□□ -1.53
LTP1P40347 NOG2YNR053C 1461 nt5.51□□□□□ -1.53
LTP1P40347 QNS1YHR074W 2145 nt5.51□□□□□ -1.53
LTP1P40347 YMD8YML038C 1329 nt5.51□□□□□ -1.53
LTP1P40347 YRA1YDR381W 681 nt5.51□□□□□ -1.53
LTP1P40347 MPS2YGL075C 1164 nt5.51□□□□□ -1.53
LTP1P40347 YNL319WYNL319W 441 nt5.51□□□□□ -1.53
LTP1P40347 YPL062WYPL062W 405 nt5.51□□□□□ -1.53
LTP1P40347 TIP41YPR040W 1071 nt5.51□□□□□ -1.53
LTP1P40347 YPK2YMR104C 2034 nt5.51□□□□□ -1.53
LTP1P40347 DIT1YDR403W 1611 nt5.51□□□□□ -1.53
LTP1P40347 KIN1YDR122W 3195 nt5.51□□□□□ -1.53
LTP1P40347 KKQ8YKL168C 2175 nt5.5□□□□□ -1.53
LTP1P40347 SKI6YGR195W 741 nt5.5□□□□□ -1.53
LTP1P40347 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.5□□□□□ -1.53
LTP1P40347 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.5□□□□□ -1.53
LTP1P40347 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.5□□□□□ -1.53
LTP1P40347 YKR104WYKR104W 921 nt5.5□□□□□ -1.53
LTP1P40347 VAM3YOR106W 852 nt5.5□□□□□ -1.53
LTP1P40347 YTA12YMR089C 2478 nt5.5□□□□□ -1.53
LTP1P40347 GIR2YDR152W 798 nt5.49□□□□□ -1.53
LTP1P40347 PGU1YJR153W 1086 nt5.49□□□□□ -1.53
LTP1P40347 MAC1YMR021C 1254 nt5.49□□□□□ -1.53
LTP1P40347 MRP51YPL118W 1035 nt5.49□□□□□ -1.53
LTP1P40347 NOT3YIL038C 2511 nt5.49□□□□□ -1.53
LTP1P40347 RNR3YIL066C 2610 nt5.49□□□□□ -1.53
LTP1P40347 SUM1YDR310C 3189 nt5.49□□□□□ -1.53
LTP1P40347 SAS4YDR181C 1446 nt5.48□□□□□ -1.53
LTP1P40347 SES1YDR023W 1389 nt5.48□□□□□ -1.53
LTP1P40347 RMD5YDR255C 1266 nt5.48□□□□□ -1.53
LTP1P40347 YGL235WYGL235W 537 nt5.48□□□□□ -1.53
LTP1P40347 MHO1YJR008W 1017 nt5.48□□□□□ -1.53
LTP1P40347 DAL82YNL314W 768 nt5.48□□□□□ -1.53
LTP1P40347 SHM1YBR263W 1473 nt5.47□□□□□ -1.53
LTP1P40347 YDL114WYDL114W 927 nt5.47□□□□□ -1.53
LTP1P40347 GTR1YML121W 933 nt5.47□□□□□ -1.53
LTP1P40347 ENV9YOR246C 993 nt5.47□□□□□ -1.53
LTP1P40347 APE3YBR286W 1614 nt5.47□□□□□ -1.53
LTP1P40347 YDR109CYDR109C 2148 nt5.47□□□□□ -1.53
LTP1P40347 GPB2YAL056W 2643 nt5.46□□□□□ -1.53
LTP1P40347 GAS3YMR215W 1575 nt5.46□□□□□ -1.53
LTP1P40347 ERC1YHR032W 1746 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YDR278CYDR278C 318 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YGR182CYGR182C 354 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 MRPL13YKR006C 795 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 PML1YLR016C 615 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 ICT1YLR099C 1185 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YLR118CYLR118C 684 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 BSC4YNL269W 396 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YNR042WYNR042W 429 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 RRP40YOL142W 723 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YOR292CYOR292C 930 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 ALG5YPL227C 1005 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 UBS1YBR165W 834 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 MEC3YLR288C 1425 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 ORC5YNL261W 1440 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YAP1801YHR161C 1914 nt5.46□□□□□ -1.54
LTP1P40347 MPC54YOR177C 1395 nt5.45□□□□□ -1.54
LTP1P40347 RAD3YER171W 2337 nt5.45□□□□□ -1.54
LTP1P40347 snR57snR57 88 nt5.45□□□□□ -1.54
LTP1P40347 RPS16BYDL083C 432 nt5.45□□□□□ -1.54
LTP1P40347 RSM10YDR041W 612 nt5.45□□□□□ -1.54
LTP1P40347 RRP45YDR280W 918 nt5.45□□□□□ -1.54
LTP1P40347 VAR1Q0140 1197 nt5.45□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YET2YMR040W 483 nt5.45□□□□□ -1.54
LTP1P40347 ISA2YPR067W 558 nt5.45□□□□□ -1.54
LTP1P40347 TAZ1YPR140W 1146 nt5.45□□□□□ -1.54
LTP1P40347 SRF1YDL133W 1314 nt5.45□□□□□ -1.54
LTP1P40347 GPI18YBR004C 1302 nt5.45□□□□□ -1.54
LTP1P40347 ALT1YLR089C 1779 nt5.44□□□□□ -1.54
LTP1P40347 BDF2YDL070W 1917 nt5.44□□□□□ -1.54
LTP1P40347 YME1YPR024W 2244 nt5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.5 ms