Protein–RNA interactions for Protein: P38349

UBX7, UBX domain-containing protein 7, yeastyeast

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX7P38349 GNA1YFL017C 480 nt7.18□□□□□ -1.26
UBX7P38349 YHR095WYHR095W 495 nt7.18□□□□□ -1.26
UBX7P38349 MRPL23YOR150W 492 nt7.18□□□□□ -1.26
UBX7P38349 YPR015CYPR015C 744 nt7.18□□□□□ -1.26
UBX7P38349 SRO9YCL037C 1305 nt7.18□□□□□ -1.26
UBX7P38349 ICL2YPR006C 1728 nt7.18□□□□□ -1.26
UBX7P38349 YIL108WYIL108W 2091 nt7.18□□□□□ -1.26
UBX7P38349 PRC1YMR297W 1599 nt7.17□□□□□ -1.26
UBX7P38349 HMRA1YCR097W 381 nt7.17□□□□□ -1.26
UBX7P38349 TIM21YGR033C 720 nt7.17□□□□□ -1.26
UBX7P38349 CUP1-1YHR053C 186 nt7.17□□□□□ -1.26
UBX7P38349 CUP1-2YHR055C 186 nt7.17□□□□□ -1.26
UBX7P38349 OM45YIL136W 1182 nt7.17□□□□□ -1.26
UBX7P38349 SMD3YLR147C 306 nt7.17□□□□□ -1.26
UBX7P38349 EMG1YLR186W 759 nt7.17□□□□□ -1.26
UBX7P38349 YML018CYML018C 1182 nt7.17□□□□□ -1.26
UBX7P38349 RAD10YML095C 633 nt7.17□□□□□ -1.26
UBX7P38349 MSS51YLR203C 1311 nt7.17□□□□□ -1.26
UBX7P38349 TEP1YNL128W 1305 nt7.17□□□□□ -1.26
UBX7P38349 KNS1YLL019C 2214 nt7.17□□□□□ -1.26
UBX7P38349 PUS9YDL036C 1389 nt7.17□□□□□ -1.26
UBX7P38349 MPA43YNL249C 1629 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 AIM10YER087W 1731 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 GUP2YPL189W 1830 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 YDR187CYDR187C 519 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 BMH1YER177W 804 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 DDI2YFL061W 678 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 DCV1YFR012W 609 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 PSR2YLR019W 1194 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 SPE4YLR146C 903 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 YBL062WYBL062W 381 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 DDI3YNL335W 678 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 YOL118CYOL118C 309 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 PHO85YPL031C 918 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 SEC62YPL094C 825 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 ERR1YOR393W 1314 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 ERR2YPL281C 1314 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 LCB2YDR062W 1686 nt7.16□□□□□ -1.26
UBX7P38349 HIS1YER055C 894 nt7.15□□□□□ -1.26
UBX7P38349 YKL077WYKL077W 1179 nt7.15□□□□□ -1.26
UBX7P38349 YLR156WYLR156W 345 nt7.15□□□□□ -1.26
UBX7P38349 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt7.15□□□□□ -1.26
UBX7P38349 YLR159WYLR159W 345 nt7.15□□□□□ -1.26
UBX7P38349 YLR161WYLR161W 345 nt7.15□□□□□ -1.26
UBX7P38349 GPN3YLR243W 819 nt7.15□□□□□ -1.26
UBX7P38349 YMR181CYMR181C 465 nt7.15□□□□□ -1.26
UBX7P38349 YNL092WYNL092W 1203 nt7.15□□□□□ -1.26
UBX7P38349 GLO4YOR040W 858 nt7.15□□□□□ -1.26
UBX7P38349 GRX5YPL059W 453 nt7.15□□□□□ -1.26
UBX7P38349 BBP1YPL255W 1158 nt7.15□□□□□ -1.26
UBX7P38349 YLH47YPR125W 1365 nt7.15□□□□□ -1.26
UBX7P38349 IML2YJL082W 2196 nt7.15□□□□□ -1.27
UBX7P38349 YDR042CYDR042C 603 nt7.14□□□□□ -1.27
UBX7P38349 UTR2YEL040W 1404 nt7.14□□□□□ -1.27
UBX7P38349 RML2YEL050C 1182 nt7.14□□□□□ -1.27
UBX7P38349 PEX14YGL153W 1026 nt7.14□□□□□ -1.27
UBX7P38349 TFG2YGR005C 1203 nt7.14□□□□□ -1.27
UBX7P38349 GTT1YIR038C 705 nt7.14□□□□□ -1.27
UBX7P38349 RPS10BYMR230W 318 nt7.14□□□□□ -1.27
UBX7P38349 RUF20RUF20 443 nt7.14□□□□□ -1.27
UBX7P38349 GSH2YOL049W 1476 nt7.14□□□□□ -1.27
UBX7P38349 MPD1YOR288C 957 nt7.14□□□□□ -1.27
UBX7P38349 YPL073CYPL073C 486 nt7.14□□□□□ -1.27
UBX7P38349 SEC18YBR080C 2277 nt7.13□□□□□ -1.27
UBX7P38349 VBA5YKR105C 1749 nt7.13□□□□□ -1.27
UBX7P38349 TDH2YJR009C 999 nt7.13□□□□□ -1.27
UBX7P38349 YKR045CYKR045C 552 nt7.13□□□□□ -1.27
UBX7P38349 VMA6YLR447C 1038 nt7.13□□□□□ -1.27
UBX7P38349 YML083CYML083C 1257 nt7.13□□□□□ -1.27
UBX7P38349 YMR122CYMR122C 375 nt7.13□□□□□ -1.27
UBX7P38349 YBR013CYBR013C 390 nt7.13□□□□□ -1.27
UBX7P38349 POC4YPL144W 447 nt7.13□□□□□ -1.27
UBX7P38349 ATG14YBR128C 1035 nt7.13□□□□□ -1.27
UBX7P38349 EXG2YDR261C 1689 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX7P38349 STB3YDR169C 1542 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX7P38349 FAA4YMR246W 2085 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX7P38349 DEG1YFL001W 1329 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX7P38349 YKL071WYKL071W 771 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX7P38349 MHT1YLL062C 975 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX7P38349 RPL31BYLR406C 342 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX7P38349 CUE4YML101C 354 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX7P38349 HEK2YBL032W 1146 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX7P38349 RPB8YOR224C 441 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX7P38349 ENV7YPL236C 1095 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX7P38349 TAE1YBR261C 699 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX7P38349 YCL041CYCL041C 495 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX7P38349 STE12YHR084W 2067 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX7P38349 MKK1YOR231W 1527 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX7P38349 MSS2YDL107W 1056 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX7P38349 BTT1YDR252W 450 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX7P38349 DSD1YGL196W 1287 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX7P38349 ECM14YHR132C 1293 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX7P38349 IRC25YLR021W 540 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX7P38349 SPC3YLR066W 555 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX7P38349 REH1YLR387C 1299 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX7P38349 ATP10YLR393W 840 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX7P38349 ROT1YMR200W 771 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX7P38349 SIT1YEL065W 1887 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX7P38349 LDB17YDL146W 1476 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX7P38349 GAS2YLR343W 1668 nt7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 676.4 ms