Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl13aP19253 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl13aP19253 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms