Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA2P15927 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA2P15927 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA2P15927 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA2P15927 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA2P15927 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA2P15927 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA2P15927 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA2P15927 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA2P15927 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA2P15927 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA2P15927 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA2P15927 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA2P15927 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA2P15927 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA2P15927 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA2P15927 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA2P15927 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA2P15927 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA2P15927 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA2P15927 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA2P15927 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA2P15927 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA2P15927 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA2P15927 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA2P15927 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA2P15927 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA2P15927 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA2P15927 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA2P15927 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA2P15927 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA2P15927 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA2P15927 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA2P15927 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA2P15927 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA2P15927 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPA2P15927 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPA2P15927 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPA2P15927 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA2P15927 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA2P15927 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA2P15927 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA2P15927 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA2P15927 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA2P15927 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA2P15927 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA2P15927 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA2P15927 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA2P15927 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA2P15927 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA2P15927 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA2P15927 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA2P15927 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA2P15927 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA2P15927 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA2P15927 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA2P15927 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA2P15927 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA2P15927 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPA2P15927 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA2P15927 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA2P15927 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA2P15927 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA2P15927 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA2P15927 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA2P15927 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA2P15927 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA2P15927 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA2P15927 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA2P15927 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA2P15927 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA2P15927 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPA2P15927 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA2P15927 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA2P15927 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA2P15927 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA2P15927 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA2P15927 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA2P15927 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA2P15927 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA2P15927 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA2P15927 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA2P15927 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPA2P15927 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA2P15927 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA2P15927 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA2P15927 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA2P15927 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA2P15927 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA2P15927 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA2P15927 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA2P15927 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA2P15927 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA2P15927 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA2P15927 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA2P15927 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA2P15927 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA2P15927 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA2P15927 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPA2P15927 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms