Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COX4I1P13073 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX4I1P13073 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms