Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24AO95486 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24AO95486 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24AO95486 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms