Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NPM3O75607 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPM3O75607 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPM3O75607 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPM3O75607 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPM3O75607 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPM3O75607 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPM3O75607 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPM3O75607 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPM3O75607 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPM3O75607 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPM3O75607 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPM3O75607 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPM3O75607 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPM3O75607 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPM3O75607 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPM3O75607 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPM3O75607 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPM3O75607 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPM3O75607 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NPM3O75607 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NPM3O75607 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPM3O75607 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPM3O75607 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPM3O75607 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPM3O75607 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPM3O75607 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPM3O75607 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NPM3O75607 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM3O75607 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM3O75607 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM3O75607 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM3O75607 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM3O75607 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM3O75607 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM3O75607 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM3O75607 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM3O75607 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM3O75607 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NPM3O75607 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NPM3O75607 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM3O75607 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM3O75607 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM3O75607 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM3O75607 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM3O75607 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM3O75607 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM3O75607 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM3O75607 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM3O75607 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM3O75607 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM3O75607 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM3O75607 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM3O75607 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM3O75607 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM3O75607 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM3O75607 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM3O75607 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM3O75607 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM3O75607 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM3O75607 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM3O75607 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM3O75607 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM3O75607 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM3O75607 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM3O75607 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPM3O75607 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPM3O75607 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPM3O75607 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPM3O75607 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPM3O75607 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM3O75607 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM3O75607 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM3O75607 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM3O75607 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM3O75607 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM3O75607 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM3O75607 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPM3O75607 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPM3O75607 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPM3O75607 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM3O75607 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM3O75607 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM3O75607 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM3O75607 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM3O75607 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM3O75607 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM3O75607 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM3O75607 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM3O75607 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM3O75607 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM3O75607 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM3O75607 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM3O75607 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM3O75607 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPM3O75607 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPM3O75607 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPM3O75607 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NPM3O75607 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPM3O75607 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms