Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFDO43915 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFDO43915 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.5 ms