Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF10AO00220 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF10AO00220 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF10AO00220 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms