Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
RGPD3A6NKT7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
RGPD3A6NKT7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RGPD3A6NKT7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms