Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85CA6NKD9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85CA6NKD9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85CA6NKD9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms