Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX3A6NHT5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMX3A6NHT5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMX3A6NHT5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms