Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms