Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMX2A2RU54 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms