Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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