Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAD54BQ9Y620 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms