Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms