Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms