Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHANK2Q9UPX8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK2Q9UPX8 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms