Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms