Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms