Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC180Q9P1Z9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC180Q9P1Z9 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms