Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms