Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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