Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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