Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SERINC1Q9NRX5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms