Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GPR88Q9GZN0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.7 ms