Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC13A1Q9BZW2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms