Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CNTNAP3Q9BZ76 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CNTNAP3Q9BZ76 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CNTNAP3Q9BZ76 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CNTNAP3Q9BZ76 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CNTNAP3Q9BZ76 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CNTNAP3Q9BZ76 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNTNAP3Q9BZ76 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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