Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms