Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF17Q9BXT8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms