Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RAB11FIP5Q9BXF6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RAB11FIP5Q9BXF6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RAB11FIP5Q9BXF6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RAB11FIP5Q9BXF6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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