Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUN5

CCDC28B, Coiled-coil domain-containing protein 28B, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC28BQ9BUN5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC28BQ9BUN5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms