Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms