Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NELL2Q99435 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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