Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCTD13Q8WZ19 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms