Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GPBAR1Q8TDU6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms