Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM46DQ8NEK8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms