Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PBRM1Q86U86 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PBRM1Q86U86 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms