Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q71RC1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q71RC1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q71RC1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms