Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2R2Q712K3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms