Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C16orf54Q6UWD8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms