Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms