Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 MGST3-202ENST00000367884 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 WNK4-201ENST00000246914 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 MASTL-201ENST00000342386 2968 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 COG6-204ENST00000455146 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 NADK-204ENST00000378625 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 DYNLT1-203ENST00000367089 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
OBSCNQ5VST9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms