Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms