Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms