Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.4 ms