Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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KRTAP21-3Q3LHN1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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KRTAP21-3Q3LHN1 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP21-3Q3LHN1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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