Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UVSSAQ2YD98 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UVSSAQ2YD98 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UVSSAQ2YD98 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UVSSAQ2YD98 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UVSSAQ2YD98 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UVSSAQ2YD98 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UVSSAQ2YD98 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UVSSAQ2YD98 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UVSSAQ2YD98 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UVSSAQ2YD98 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms