Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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